文章目录

1 材料与方法

1.1 材料

1.2 方法

    1.2.1 差异表达基因检测和基因功能富集分析

    1.2.2 免疫细胞浸润度分析

    1.2.3 单细胞转录组数据分析

    1.2.4 统计学处理

2 结果

2.1 皮肤组织中炎症相关基因在衰老皮肤中转录表达水平上升

2.2 衰老皮肤组织中免疫细胞浸润水平较年轻皮肤组织的异质性大

2.3 衰老皮肤组织中T细胞类群数量较年轻皮肤组织显著减少

2.4 衰老皮肤组织中免疫相关基因在非免疫细胞显现表达上调趋势

3 讨论

文章摘要:目的 研究皮肤自然衰老过程中基因表达和免疫微环境的动态变化。方法 收集GTEx项目中699个皮肤组织转录组测序数据（RNA-seq）,依据年龄段分为年轻组（20～39岁）和衰老组（60～79岁）,进行差异基因表达分析。用CIBERSORT预测样本的免疫细胞浸润度，分析其随皮肤衰老的动态变化；用Seurat对已公开皮肤单细胞转录组数据（scRNA-seq）进行分析，观察免疫细胞群体随衰老的动态变化；比较年轻组和衰老组各细胞类群中免疫相关基因的动态表达变化。结果 对年轻组与衰老组进行差异表达分析显示，非暴露和暴露皮肤组织中转录表达水平发生了明显变化，衰老皮肤组织中转录上调的基因中显著富集炎症相关通路；多年龄段数据分析显示49个炎症水平相关基因的表达水平随皮肤衰老逐渐上调。免疫细胞浸润度预测分析显示年轻组与衰老组间无明显差异，但其在衰老皮肤组织中个体异质性大；对衰老和年轻皮肤组织的scRNA-seq进行分析，发现T细胞及其他免疫细胞亚群的大小随衰老逐渐下降，同时发现非免疫细胞中免疫相关基因随皮肤衰老表达上调。结论 皮肤衰老过程中基因转录表达和免疫微环境发生明显改变，炎症相关基因明显上调；T细胞类群数量明显减少，多种主要非免疫细胞类群表达炎症相关因子，表明非免疫细胞可能在皮肤衰老过程中发挥重要作用。

文章关键词:

论文作者:滕小娟 林静霞 张永军 曾鑫权 李雪飞 何仁亮 周家健 

作者单位:南方医科大学皮肤病医院 

论文分类号:R751